مواقف البرتغاليين من سيطرة عمان على مستعمراتهم في شرق أفريقيا، ومحاولاتهم في إضعاف الحكم داخل عمان ومتابعتهم للأوضاع الأمنية بها، والتجهيزات العسكرية البرتغالية ضد عمان، وإستغلال البرتغال وفاة إمام مسقط للهجوم عليها، وتحالف إيران والبرتغال لمحاربة عمان، سيطرة عمان على قلعة ممباسا ومحاولات البرتغال لإرجاعها.

• الحرب بين البرتغاليين والمسلمين .
• إتفاق السلام الذي ينص على تبعية مملكة هرمز لملك البرتغال دون جوان الثالث ،وأن يتم تقديم تاجا ذهبيا يزن قيمته 2000 شارافين (عملة نقدية) سنويا للملك البرتغال ،وأن لا يفرض على البرتغاليين الذين يقصدون مرفأ عدن سوى نصف الرسوم المفروضة على غيرهم من الأجانب.
• الخسائر التي لحقت بالبرتغاليين بسبب ملك عدن.

• رسالة من برناديم دي سوزا إلى دون جوان الثالث حول حرب هرمز والأتراك.

تعليمات وتجهيزات عسكرية، وحرب بين البرتغاليين والعمانيين، الاهتمام بالافراج عن سجين برتغالي يدعى بيرو لاميقو باليا في السجون البرتغالية حيث دخل الاسلام وتزوج وحارب مع العمانيين .

-مراسلات حول عدة مواضيع منها :

• تقسيم العبيد الذين إحتجزهم البرتغاليون في صحار.
• تعليمات بشأن السفر إلى هرمز، وبيع بعض البضائع والعقاقير .
• الإستيلاء على عدن من قبل الأتراك .
• التحذير من وجود القراصنة في منطقة رأس الحد وقلهات ومسقط وخورفكان .
• تعليمات السفر إلى عدن ونقل الأخبار للقائد.
• أخبار مسقط وهرمز وهجوم الأتراك عليها.
• إرسال عدد من المسؤولين إلى قلهات للسؤال عن غراب ملك هرمز.
• أخبار البصرة وهرمز .

مراسلات برتغالية مجمعة بعنوان وثائق عن الهند أو كتاب المواسم، مترجمة إلى اللغة العربية تتناول العلاقات البرتغالية التجارية والسياسية مع حكومة مملكة هرمز و الخلافات على الحكم فيها (1611م - 1613م)، وكذلك الصراع على جزيرة البحرين، والتنافس التجاري في منطقة الخليج العربي.

مراسلات حول العلاقات البرتغالية الفارسية، وسعي البرتغاليين في التنافس للسيطرة على المراكز التجارية الهامة (جزيرة البحرين،البصرة) في المنطقة، ونشر الدين المسيحي في ديو وهرمز وتدابير لتنقيص عدد معابد وبيوت الوثنية فيها، والنظر في الخلاف بين ملك هرمز وشقيقه على العرش، وحول تحصين هرمز وترميم قلعتها وتأمين إحتياجاتها من المواد الغذائية والذخيرة، وشكاوي إدارية على قادة قلعة هرمز لتجاوزاتهم في معاملة التجار، وتعيين بواب جمارك القلعة وقائد للأسطول في هرمز مهمته الدفاع عنها، ومنح ملك البرتغال المسلمين المقيمين في هرمز حقوق وإمتيازات كالأعيان البر

مراسلات القادة إلى ملك البرتغال حول توضيح أسباب قلة عائدات جمارك هرمز، وحصر مصادر العائدات وهي عائدات السفن البحرية القادمة من الهند ومن كانبايا وعائدات قوافل البر من الشيخ اسماعيل ومن البصرة،عقداتفاقية السلام بين القائد سليمان - سيد مضيق هرمز - مع عدن، مراقبة المراكب البحرية القادمة من مكة إلى كانبايا، مراقبة سواحل مضيق هرمز، وبيع توابل الشرق (سوريا، الهند، الاسكندرية)، ونشر الديانة المسيحية في هرمز، الخلاف بين الامير محمد حاكم البحرين والشيخ مانع بن رشيد ،استعداد الفرس لشن حرب ضد السلطان التركي .

• رسالتين للملك دون جوان الثالث حول طلب مساعد

تقرير حول آسيا موقعها وتقسيماتها وديانات الشعوب فيها، وحول السيطرة على قلعة سقطرى، والمعارك التي خاضها أفونسو دالبوكيركي والمقاومة التي تلقاها بعد مطالبته بدفع الجزية في قلهات، وقريات، ومسقط، وصحار، وخورفكان، وهرمز، والخسائر والأضرار التي أحدثها.

تقارير حول مباحثات ومفاوضات الدعم البرتغالي لإيران ضد عمان، ونص إتفاق التحالف البرتغالي الفارسي ضد عمان، والأطماع البرتغالية في مسقط، وتعليمات سرية لتدابير عسكرية برتغالية ضد عمان.